La historia comenzó en 1923 cuando hubo la necesidad de crear un club que llevara la representación de los barrios San Roque y Rebol. Existía un Movimiento futbolero gestado dentro de la influencia del colegio de los hermanos salecianos quienes fundaron el equipo "Juventus" por ser ellos de ascendencia Italiana y que luego se conociera como "Juventud". Se forjó el deseo de conformar otro conjunto y fué así como el 16 de Agosto de 1923 se reunieron por primera vez un grupo de jóvenes en la casa de Manuel "Mañe" Vásquez.
Pasó el tiempo y aumentó la espectativa para la creación del club, además de la creciente motivación de los jugadores menores del "Juventud",Doña Micaela Lavalle de Mejía, una fiera enamorada del fútbol, se puso al frente y en compañía de su hijo Juán contagiaron a un grupo de personas para adelantar la empresa, desarrollándose varias conversaciones para ello, hasta llegar a la noche del 7 de agosto de 1924 cuando se produjo la reunión debajo de un puente o tunel localizado en la Calle de Las Vacas con Carrera Buen Retiro, con el entorno de los tradicionales árboles de Matarrón barranquilleros, donde se congregaron jugadores y se proclamó el nacimiento del nuevo Club al que se le dió el nombre de "Juventud Infantil
En 1926 ingresa a la Liga de Fútbol del Atlántico en la tercera categoría, coronándose campeón y ganando el ascenso a la segunda donde se paseó victorioso en 1927 hasta llegar a 1929 a la primera categoría tomando nombre de "Juventud Junior" para posteriormente lograr el título de Campeón en 1932, época romántica del fútbol, cuando militaban equipos de gran categoría en la liga.
En esta era que fue de gran importancia para el progreso del JUNIOR el apoyo y empuje de un dirigente como fue Rafael Fernández Díaz. En 1936 el equipo pasó a ser llamado simplemente JUNIOR, portando entre sus filas a jugadores como Roberto Flaco Melendez y Romelio Martínez, entre otras grandes estrellas.
Entre 1939 y 1940 JUNIOR realiza algunos partidos internacionales bajo la dirección técnica del inglés Jack Greenwell, regando su fama más allá de las fronteras.
Entre 1942 y 1947 sigue su rumbo victorioso, considerándose el mejor equipo de Colombia; la mística y la técnica impuesta en cada jornada eran su caracteristica principal, lo cual identificaba plenamente al fútbol barranquillero
En 1945 bajo la tutela del Fútbol Colombiano "ADEFUTBOL", prestó su concurso para participar en el Torneo Sudamericano de fútbol en Chile.
En 1948 con el Nombre de ATLETICO JUNIOR, ingresó a la DIMAYOR, organismo creado para gobernar el fútbol Profesional Colombiano. El equipo se conforma con todas sus grandes estrellas que tenía en años anteriores, teniendo como director técnico a Roberto"Flaco" Meléndez y como presidente a Ernesto Alvarez Correa, logrando en una gran campaña el subcampeonato.
Al año siguiente alser requerido por la ADEFUTBOL, participa como Selección Nacional en el sudamericano de Río de Janeiro, motivo por el cual es sancionado por la DIMAYOR 2 años, rompiendose las relaciones entre la ADEFUTBOL y la DIMAYOR. Junior regresa a la DIMAYOR en 1950, luego de levantarse la sanción, contando entre sus filas a jugadores brasileños como Harold Carijó, Marinho Rodríguez de oliveira, Elba De Padua Lima "TIM", Helenio De Freitas, Sebastián Berascochoa, teniendo la conducción en la parte directiva de Don Mario Abello Lobo. Al final del torneo se ubica en la octava posición. En 1952, con la inyección de jugadores europeos logra la sexta posición. Al año siguente con la presidencia de Don Ernesto Mckauslan, logra la octava posición, afrontando al final una grave crisis económica que lo obliga a retirarse de la DIMAYOR. En los años siguientes compite en los torneos aficionados locales y regionales. En 1965, a raíz del fervor despertado por la eliminatoria al mundial de Inglaterra, jugada en Barranquilla, se desarrolló un movimiento para buscar el reingreso de JUNIOR a la DIMAYOR. Estaban al frente dirigentes como Alberto Mario Pumarejo, Mario Abello, Guy de Castro, Antonio Angulo, Arturo Fernández R., José Benavidez, Mario Zeppenfeld, Imre Danko, Guillermo Marín, Roberto Pumarejo, Sixto Díaz Granados, Juan B. Fernández R. entre otros, quienes lograron despertar el interés para conseguir el objetivo.Se llamó a varios jugadores de la selección nacional, incorporándose además jugadores brasileños, con lo cual se compitió en el torneo de la DIMAYOR en 1966, desplegando un gran juego, siguiendo en los años posterioresy entregando grandes satisfacciones a su hinchanda. En 1972 se vincula a la junta directiva Don Fuad Char Abdala, quien se ha constituído en gran impulsor de la divisa hasta los días presentes. Durante todos estos años desfilaron por JUNIOR jugadores de talla mundial como Edvaldo Alves de Santa Rosa "Dida", Manuel Dos Santos "Garrincha", Victor Ephanol, Juan Ramón Verón, Carlos Babington, entre otros quienes hicieron vibrar de emoción con sus grandes jugadas a la hinchada. En 1977, 1980, 1993 y 1995 JUNIOR logra 4 campeonatos nacionales, con la dirección técnica deJuan Ramón Verón, José Varacka, Julio Avelino Comesaña y Carlos Restrepo, respectivamente. El club estuvo presidido en 1977 y 1980 por Fuad Char Abdala, en 1993 por Antonio Char Chaljud y en 1995 por Pedro Salcedo. En 1948, 1970 y 1983 JUNIOR alcanza en Subcampeonato con la dirección técnica de Roberto Meléndez Lara, Luis Miloc y Jorge Solari, respectivamente. En total ha participado en ocho versiones de la "Copa Libertadores de América"; en 1994 avanzó hasta la semifinal de este importante evento y perdió en los tiros del punto penal ante el Velez Sarsfield de José Luis Chilavert. También participó en la "Copa Conmebol" de 1992, "Copa Simón Bolivar "1970, 1972. Obtuvo el título de Campeón de la Internacional "Copa Reebok" 1997, realizada en Estados Unidos con la participación de los equipos Borussia M. de Alemania, Palmeiras de Brasil y Nexaca de México, con la conducción técnica del peruano Julio César Uribe. JUNIOR cuenta con sus Divisiones Menores participando en los torneos aficionados que organiza la liga de fútbol del Atlántico y la División Aficionada del Fútbol Colombiano "DIFUTBOL". Tiene equipos en Divisiones "Reservas", "C", Nacional Juvenil de Clubes, Ascenso, Juvenil, prejuvenil, preinfantil, pony, además de los equipos escuelas de apoyo en la ciudad y departamento del Atlántico.
Primera Estrella
En 1977 llegan al equipo el volante argentino Eduardo "El Indio" Solari y Alfredo "El Maestrico" Arango. Vuelve el defensa Jesús "El Toto" Rubio. En el Torneo Apertura, Junior termina primero con 35 puntos, dos más que su perseguidor Deportivo Cali. Así, Junior ganaba el Torneo Apertura y clasificaba automáticamente al Hexagonal Final. En el Torneo Finalización, Junior quedó ubicado en el grupo A, quedando último con 18 puntos. En el Hexagonal Final, Junior terminó primero con 15 puntos, tres más que el subcampeón Deportivo Cali. Así, Junior obtenía su primer campeonato nacional y su segunda Copa Libertadores.19 Al final de la temporada se van del equipo los argentinos Eduardo "El Indio" Solari, Juan Ramón Verón y Juan Carlos Delménico.
Alineación:
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Segunda Estrella
En 1980 vuelve el arquero argentino Juan Carlos Delménico. En el campeonato colombiano, Junior termina líder del Torneo Apertura con 35 puntos, con los mismos puntos del segundo (Deportivo Cali). Junior y Deportivo Cali clasificaron a los Cuadrangulares Semifinales. En el Torneo Finalización, Junior queda último del grupo A con 10 puntos. En los Cuadrangulares Semifinales, Junior terminó líder del grupo B con 8 puntos, 1 más que el segundo Atlético Nacional, clasificando al Cuadrangular Final, en donde enfrentaría a Atlético Nacional, Deportivo Cali y América de Cali. Junior queda campeón al no perder ningún partido en el Cuadrangular Final y cosechar 9 puntos, sacándole 2 de ventaja al Deportivo Cali que quedó subcampeón con 7 puntos. Junior así conseguía su segunda estrella y su tercera clasificación a Copa Libertadores.22
Alineación:
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Suplentes: Jaime de Luque, Carlos de la Torre, Rafael Reyes, Fernando Fiorillo, Oscar Fornari.
Tercera Estrella
En 1993 vuelven Alexis Mendoza, Miguel "Niche" Guerrero y Oswaldo Mackenzie. Llegan por primera vez Jorge Bolaño y el máximo ídolo en la historia del equipo y mejor jugador colombiano de la historia:34 Carlos "El Pibe" Valderrama. En el Torneo Apertura, Junior queda líder del grupo B con 21 puntos (5 más que el segundo Atlético Nacional) clasificando a los Cuadrangulares Finales. En el Torneo Finalización, Junior termina segundo con 35 puntos (4 menos que el líder Independiente Medellín). De bonificación de los dos torneos, Junior recibió 1,50 puntos. En los Cuadrangulares Finales, Junior queda en el grupo A junto a Atléitco Nacional, Millonarios y Once Caldas. Junior queda segundo con los mismos puntos que el líder Atlético Nacional (8,50 puntos). En el Cuadrangular Final, Junior queda líder con 7 puntos (los mismos que el Independiente Medellín). Miguel Ángel "El Niche" Guerrero queda goleador con 34 goles.35 Junior clasifica a su quinta Copa Libertadores y gana por tercera vez el campeonato colombiano.
Alineación:
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Suplentes: Luis Octavio Gómez, Flaminio Rivas, Luis Grau, Carlos Araujo, Adriano Samaniego.
Cuarta Estrella
En 1995 queda campeón de Torneo Colombiano con 62 puntos (2 más que el subcampeón América de Cali. Así, Junior gana por cuarta vez el campeonato colombiano y clasifica a su sextaCopa Libertadores. Iván René Valenciano es goleador con 24 goles.37
Alineación:
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Suplentes: Alfredo Steffanel, Ronald Valderrama, Carlos Araujo, Oswaldo Mackenzie, Marcio Rodríguez.
Quinta Estrella
En el 2004 llega al equipo Omar Sebastián Pérez, en su primera experiencia en Colombia y sin gran cartel, comandando al equipo hacia el quinto campeonato de la Primera A, teniendo como técnico a Miguel Ángel "El Zurdo" López. Además, ese mismo año participa en su primera y hasta ahora única Copa Sudamericana. En la eliminatoria colombiana jugó contra Millonarios de Bogotá, perdiendo el primer partido 1-0 en Bogotá y ganando 2-0 en Barranquilla logrando un resultado global de 2-1. En los octavos de final se enfrenta al ganador de la eliminatoria peruana:Alianza Atlético de Sullana. Junior vence de nuevo en los dos partidos 2-0 en Sullana y 4-1 en Barranquilla para un resultado global de 6-1. Junior clasifica a los Cuartos de Final para enfrentar aInternacional de Brasil. Junior pierde 1-0 en Porto Alegre y empata 1-1 en Barranquilla.
En el Torneo Apertura 2004, Junior termina quinto con 30 puntos, clasificando a los Cuadrangulares Semifinales. En los cuadrangulares, Junior queda ubicado en el grupo A junto a Nacional,América y Pasto. Junior termina último con 6 puntos. En el Torneo Finalización, Junior clasifica a los cuadrangulares semifinales, octavo con 28 puntos. Queda ubicado en el grupo B junto aDeportivo Cali, Independiente Medellín y Atlético Bucaramanga, clasificando a la final con 13 puntos (5 más que el Deportivo Cali). En la Final, Junior enfrenta a Atlético Nacional. En el partido deBarranquilla, Junior vence 3-0. En el partido de Medellín, Nacional vence a Junior 5-2, quedando un resultado global de 5-5 y obligando a la serie de penales en donde Junior vence 5-4. Junior así obtenía su quinto título nacional y su novena clasificación a Copa Libertadores.47 También Junior fue campeón del torneo amistoso Copa Cotton USA, realizada en Medellín como homenaje a los 10 años de la muerte de Andrés Escobar.
Alineación:
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Suplentes: Carlos Pérez, Jorge Amara, Freddy Arrieta, Daniel Machacón, Wilson Carpintero
Sexta Estrella
Para el 2010 llegan al equipo Paulo César Arango, Martín Arzuaga y el defensa panameño Román Torres como principales contrataciones. En la Copa Libertadores queda eliminado al perder la serie con Racing de Uruguay 4-2. En el Torneo Apertura termina tercero del todos contra todos con 32 puntos, dos menos que el líder Deportes Tolimaluego de una sufrida clasificación en el que se le dieron los resultados que necesitaba y venció 2-0 a Envigado F. C.. En la semifinal venció a Medellín. En la final enfrentó aEquidad venciendolo 3-2 en una final de infarto que se definió por un gol de carambola de Carlos Bacca faltando cuatro minutos para el final del encuentro. Junior así ganaba su sexto campeonato colombiano y clasifica a la Copa Libertadores. Carlos Bacca es goleador con 12 goles, los mismos de Carlos Rentería de La Equidad. Por la Copa Colombia, Junior logra terminar 2° del grupo A con 18 puntos, los mismos que el líder Real Cartagena, quien los superaba por diferencia de goles (5 contra 4), clasificando directamente a los octavos de final, a disputarse al siguiente semestre. Al final del campeonato salen el portero uruguayo Adrian Berbia, así como los delanteros Martín Arzuaga y Emerson Acuña.
Alineación:
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Suplentes: Adrian Berbia, Brayner García, Jaider Romero, Frank Pacheco, Martín Arzuaga
Para el Torneo Finalización 2011 se cambia nuevamente de presidente, siendo Antonio Char el sucesor de Arturo Char. Junior contrata a Cristian Mejía como principal contratación, procedente del fútbol uruguayo. Despues de 3 fechas del campeonato, donde se consiguió una derrota 0 a 3, un empate 0 a 0 y una victoria 4 a 0, Jorge Luis Pinto dejaría la dirección técnica tan solo 3 meses después de asumirla al aceptar una oferta para dirigir a la Selección Costa Rica. Su reemplazo sería José Eugenio "Cheché" Hernández recomendado por el mismo Pinto. El equipo termina 1° en el todos contra todos por primera vez en los torneos cortos, con 1 punto de ventaja sobre el escolta Itagüí Ditaires. En los cuartos de final enfrenta a Boyacá Chicó en una polémica serie donde solo se jugaron 45 minutos en Tunja debido a la agresión a un juez de linea. Boyacá Chicó fue sancionado con la anulación del punto que conseguía hasta ese momento, siendo suficiente el empate 2 a 2 en Barranquilla (después de estar el partido 0-2 en contra de Junior) para lograr clasificar a las semifinales, donde enfrentaría a Millonarios en una serie épica donde Junior perdió 3-0 en Bogotá y remontó con el mismo marcador en Barranquilla, definiendo la clasificación desde los penales, donde Junior se impuso 5-4, en un partido donde la afición se hizo sentir. En la final enfrentaría a Once Caldas, ganando 3-2 en Barranquilla (después de remontar un 0-2) y perdiendo 2-1 en Manizales definiendo el título con un 2-4 en los penales, logrando su séptimo título colombiano y la clasificación a la Copa Libertadores 2012. Igualmente, Carlos Bacca logra el Botín de Oro por 2° año consecutivo al anotar 12 goles (2 más que sus perseguidores Germán Cano del Pereira, Lionard Pajoy del Itagüí y su hermano John Pajoy del Once Caldas).
Séptima Estrella
Alineación:
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Suplentes: Carlos Rodríguez, Brayner García, Sherman Cárdenas, Víctor Cortés, Luis Páez, César Fawcett
• Mayor goleada encajada:
o En campeonatos nacionales: 6-1 con Millonarios el 5 de diciembre de 1948 , con Deportivo Cali el 12 de junio de 1983 y con América el 18 de agosto de 1987
o En torneos internacionales: 5-0 con Rosario Central en la Copa Libertadores 1981 • Máximo goleador: Ivan René Valenciano 158 goles • Más partidos disputados: Dulio Miranda 427 partidos
o En campeonatos nacionales: 6-1 con Millonarios el 5 de diciembre de 1948 , con Deportivo Cali el 12 de junio de 1983 y con América el 18 de agosto de 1987
o En torneos internacionales: 5-0 con Rosario Central en la Copa Libertadores 1981 • Máximo goleador: Ivan René Valenciano 158 goles • Más partidos disputados: Dulio Miranda 427 partidos
• Participación internacional
o Copa Libertadores de América (10):
Semifinal: 1994
Cuartos: 1996
Octavos: 2000, 2001, 2005
Primera fase: 1971, 1978, 1981, 1984, 2010
o Copa Sudamericana (1):
Cuartos: 2004
o Copa Conmebol (1):
Cuartos: 1992
o Copa Libertadores de América (10):
Semifinal: 1994
Cuartos: 1996
Octavos: 2000, 2001, 2005
Primera fase: 1971, 1978, 1981, 1984, 2010
o Copa Sudamericana (1):
Cuartos: 2004
o Copa Conmebol (1):
Cuartos: 1992
• Jugadores históricos Acorde con la web oficial del club
• Carlos Valderrama
• Dulio Miranda
• Efraín "Caiman" Sánchez
• Miguel Guerrero
• José María Pazo
• Roberto "Flaco" Melendez
• Alexis Mendoza
• Óscar Bolaños
• Jesus "Toto" Rubio
• Iván René Valenciano
• Víctor Danilo Pacheco
• Gabriel Berdugo
• Didi Valderrama
• Teofilo Gutierrez
• Alfredo Arango
• Giovanni Hernandez
• Hayder Palacio
• Oswaldo Mackenzie
• Jorge Bolaño
• Imre Danko
• Omar Alfredo Galván
• Juan Ramón Verón
• Juan Carlos Delmenico
• Carlos Ischia
• Edgardo Bauza
• Omar Perez
• Carlos Babington
• Heleno de Freitas
• Víctor Ephanor
• Garrincha
• Dida
• Paulo Cesar De Lima
• Julio César Uribe
• Julio Avelino Comesaña
• Carlos Valderrama
• Dulio Miranda
• Efraín "Caiman" Sánchez
• Miguel Guerrero
• José María Pazo
• Roberto "Flaco" Melendez
• Alexis Mendoza
• Óscar Bolaños
• Jesus "Toto" Rubio
• Iván René Valenciano
• Víctor Danilo Pacheco
• Gabriel Berdugo
• Didi Valderrama
• Teofilo Gutierrez
• Alfredo Arango
• Giovanni Hernandez
• Hayder Palacio
• Oswaldo Mackenzie
• Jorge Bolaño
• Imre Danko
• Omar Alfredo Galván
• Juan Ramón Verón
• Juan Carlos Delmenico
• Carlos Ischia
• Edgardo Bauza
• Omar Perez
• Carlos Babington
• Heleno de Freitas
• Víctor Ephanor
• Garrincha
• Dida
• Paulo Cesar De Lima
• Julio César Uribe
• Julio Avelino Comesaña
Cuerpo técnico 2010
• Entrenador: Diego Edison Umaña
• Asistente Técnico: Alex Escobar
• Preparador de Arqueros: Roberto Vasco Agudelo
• Preparador Físico: Ramón Vasquez
• Preparador Físico Auxiliar: Giovanni Floriano
• Preparador Físico (Evaluador): José Luis Davila
• Médico: Carlos Rolong
• Médico: Luís Ochoa
• Kinesiólogo: Marco Varela
• Kinesiólogo: Maikol Ortiz
• Utilero: Leyder Frías
• Utilero: Luis Aguilera
• Entrenador: Diego Edison Umaña
• Asistente Técnico: Alex Escobar
• Preparador de Arqueros: Roberto Vasco Agudelo
• Preparador Físico: Ramón Vasquez
• Preparador Físico Auxiliar: Giovanni Floriano
• Preparador Físico (Evaluador): José Luis Davila
• Médico: Carlos Rolong
• Médico: Luís Ochoa
• Kinesiólogo: Marco Varela
• Kinesiólogo: Maikol Ortiz
• Utilero: Leyder Frías
• Utilero: Luis Aguilera
